9日の家庭連合によると、日本政府は2022年11月から2023年8月にかけて7回、約500件の質問権を行使し、2023年9月にはそのうち約100件に回答せず、2023年9月には裁判所に罰金を科すよう求めた。捜査は2022年7月、安倍晋三元首相が選挙運動中に山上徹也氏に射殺されたことから始まった。山上は、母が家庭連合に過度に寄付をして不利な立場を過ごしていたことや、安倍元首相が家庭連合に対して友好的な姿勢をとっていたことを述べた。

家庭連合はまた、日本政府による家庭連合の解散命令は、憲法が保障する信教の自由を侵害すると強調した。特に解散命令は「民法上の違法行為」に基づくものであることを指摘し、前例のない宗教迫害であると主張した。これまでに日本で解散した宗教法人は、オウム真理教と明覚寺の2つで、どちらも犯罪を犯し、莫大な人命と財産の損失をもたらしました。家庭連合会は、「1964年に日本で宗教法人として認可されてから60年間活動し、刑事訴追されていない団体を解散する前例は、自由民主主義の国で見つけるのは難しい」としている。米国政府は、昨年6月に発表した「2023年国際宗教の自由報告書」で、この問題を指摘し、「規範から逸脱している」と特徴づけました。J・D・バンス米副大統領は2月に開催された2025年国際宗教自由サミットに出席し、「トランプ政権は2期目で宗教的迫害と戦う」と述べた。当初は「刑事罰を受けたことがなく、解散を命じるのは難しい」としていた日本政府は、岸田文雄元首相が在任中に「民法上の違法行為も解散要件に該当する可能性がある」と発言したことをきっかけに、立場を変えた。

家庭連合はまた、家族連合のメンバーであることによる誘拐、投獄、強制改宗が公然と行われていると主張した。家庭連合は、「強制拘束と改宗の結果、家庭連合に対する民事訴訟が増加した」と述べ、「日本政府が解散命令を要請して以来、家庭連合は『悪い宗教団体』の烙印を押され、世論によって裁判にかけられている。より大きな問題は、その構成員に対する深刻な二次被害だ」と付け加えた。